La bioerosión describe la descomposición de los sustratos oceánicos duros - y con menos frecuencia los terrestres - por organismos vivos. La bioerosión marina puede ser causada por moluscos, gusanos poliquetos, forónidos, esponjas, crustáceos, equinoides y peces; puede ocurrir en las costas, en los arrecifes de coral y en los barcos; sus mecanismos incluyen la perforación biótica, la perforación, y el raspado. En tierra firme, la bioerosión suele ser realizada por plantas pioneras u organismos similares a las plantas, como el liquen, y en su mayor parte es de carácter químico (por ejemplo, mediante secreciones ácidas en la piedra caliza) o mecánico (por ejemplo, mediante las raíces que crecen en las grietas) en la naturaleza.
La bioerosión de los arrecifes de coral genera la arena de coral fina y blanca característica de las islas tropicales. El coral es convertido en arena por bioerosionadores internos como algas, hongos, bacterias y esponjas (Clionaidae), bivalvos (incluyendo Lithophaga), sipunculanos, poliquetos, percebes acrotorácicos y forónidos, generando un sedimento extremadamente fino con diámetros de 10 a 100 micrómetros. Entre los bioerosionadores externos se encuentran los erizos de mar (como Diadema) y los quitones. Estas fuerzas en conjunto producen una gran cantidad de erosión. Se ha informado de la erosión del carbonato cálcico por parte de los erizos de mar en algunos arrecifes a tasas anuales que superan los 20 kg/m².
Los peces también erosionan el coral al comer algas. Los peces loro causan una gran cantidad de bioerosión usando los músculos de la mandíbula bien desarrollados, la armadura de los dientes y un molino faríngeo, para moler el material ingerido en partículas del tamaño de la arena. La bioerosión de la aragonita de arrecife de coral por parte de los peces loro puede oscilar entre 1017,7±186,3 kg/año (0,41±0,07 m³/año).(Bellwood, 1995)
La bioerosión también es muy conocida en el registro fósil de conchas y suelos duros (Bromley, 1970), con rastros de esta actividad que se remontan hasta bien entrado el Precámbrico (Taylor & Wilson, 2003). La macrobioerosión, que produce perforaciones visibles a simple vista, muestra dos radiaciones evolutivas distintas. Una se produjo en el Ordovícico Medio (la revolución de la bioerosión del Ordovícico; véase Wilson & Palmer, 2006) y la otra en el Jurásico (véase Taylor & Wilson, 2003; Bromley, 2004; Wilson, 2007). La microbioerosión también tiene un largo registro fósil y sus propias radiaciones (véase Glaub & Vogel, 2004; Glaub et al., 2007).
Taladros de Trypanites en un terreno duro del Ordovícico Superior, al sudeste de Indiana; véase Wilson y Palmer (2001).
Perforaciones de Petroxestes en un terreno duro del Ordovícico Superior, en el sur de Ohio; véase Wilson y Palmer (2006).
Perforaciones de Gastrochaenolites en un terreno duro del Jurásico Medio, al sur de Utah; véase Wilson y Palmer (1994).
Numerosas perforaciones en una roca del Cretáceo, Faringdon, Inglaterra; véase Wilson (1986).
Sección transversal de un terreno rocoso del Jurásico; las perforaciones incluyen Gastrochaenolites (algunas con bivalvos perforadores en su lugar) y Tripanites; Mendip Hills, Inglaterra; barra de escala = 1 cm.
Teredolites taladrados en un muelle moderno; acción de los bivalvos conocidos como "gusanos de barco".
Sección transversal del suelo duro del Ordovícico con perforaciones de tripanitas rellenas de dolomita; sur de Ohio.
Gastrochaenolitas perforadas en un coral escleractínico recristalizado, Formación Matmor (Jurásico Medio) del sur de Israel.
Perforaciones de Osprioneides en un estromatoporoide silúrico de Saaremaa, Estonia; véase Vinn, Wilson y Mõtus (2014).
Gnathichnus pentax traza fósil en una ostra del Cenomaniano de Hamakhtesh Hagadol, al sur de Israel.
Estructura geopétalica en perforación bivalva en el coral; concha bivalva visible; Formación Matmor (Jurásico Medio), sur de Israel.
Taladros en un briozoario del Ordovícico Superior, Formación Bellevue, norte de Kentucky; sección transversal pulida.
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