Charles Bonnet (Ginebra, 13 de marzo de 1720-ibíd., 20 de mayo de 1793) fue un biólogo y filósofo suizo. Fue uno de los principales exponentes de la idea de Scala naturae y autor de importantes descubrimientos biológicos, como la partenogénesis.
Protestante de origen francés, su familia tuvo que huir de Francia después de la matanza de San Bartolomé. Charles Bonnet desarrolla una gran pasión por la biología después de leer el Espectáculo de la Naturaleza de Noël-Antoine Pluche (1688-1761) y los trabajos de Réaumur, con quien mantuvo correspondencia desde los 18 años.
Bonnet se apasiona por la reproducción de los áfidos y obtiene once generaciones sucesivas sin fecundación. Asimismo estudia la respiración de las orugas y las mariposas, la anatomía de la tenia y la facultad de reconstitución de los órganos perdidos en los gusanos.
En 1745 publica un Tratado de insectología por el que es admitido en la Academia de Ciencias de París. En 1754 publica el Tratado sobre el uso de las hojas, que provoca la admiración de Cuvier (1769-1832).
Sus investigaciones se ven trabadas por la ceguera. No pudiendo hacer uso del microscopio, se orienta hacia la biología teórica y compone varios escritos filosóficos, como el Ensayo de psicología (1754) o el Ensayo analítico sobre las facultades del alma (1760).
En 1762 publica Consideraciones sobre los cuerpos organizados, donde expone su preformacionismo. Según la teoría sobre la preexistencia de los gérmenes, la producción de un nuevo ser vivo se debe a la evolución de un germen preexistente. Esta teoría permitía explicar la aparición de los seres sin contradecir a la Biblia, pues todos los gérmenes habrían sido creados en el Génesis.
En 1764 publica Contemplación de la naturaleza que lo convierte en una célebre personalidad, también fuera de los círculos científicos.
Su obra más ambiciosa es Palingénésie philosophique (1769), donde aúna conocimientos de todos los campos (geología, biología, psicología y metafísica). De orientación leibniziana, defiende la inmortalidad del alma animal.
Continúa su reinterpretación del Génesis en las Investigaciones filosóficas sobre las pruebas del cristianismo de 1773.
Sus trabajos le valieron los sarcasmos de Voltaire.
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