El Jardín Botánico de Bolonia (en italiano: Orto Botanico dell'Università di Bologna) es un jardín botánico y herbario ubicado en la Universidad de Bolonia, de 2 hectáreas de extensión, delimitado al norte por las murallas de la ciudad antigua y al sur por la Vía Irnerio.
El primer jardín de simples de la universidad de Bolonia se fundó en 1568, fue el cuarto de Europa tras el de Pisa, Padua y Florencia. Se ubicó en el patio del palacio de Accursio por iniciativa de Ulisse Aldrovandi.
A medida que la botánica avanzaba y se desligaba de la medicina, el emplazamiento inicial, en el que se cultivaban únicamente plantas medicinales para su estudio médico, resultó pequeño e inadecuado, por lo que en 1587 se trasladaron los cultivos a un terreno cercano a la actual Porta Santo Stefano, donde hacia 1595 la colección se amplió a cerca de 3000 plantas.
La sede actual y definitiva del jardín botánico se reubicó en 1803, cuando la universidad compró unos terrenos dentro de las murallas de la ciudad, en el que ya existían jardines y paseos arbolados.
El jardín alberga unos 5000 ejemplares de plantas, entre exóticas y locales, y está dividido en varias zonas.
El herbario actual contiene en total unos 130.000 especímenes que abarcan todos los grupos taxonómicos y todas las regiones geográficas.
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