Llobregat de Ampurdán es un Lugar de Importancia Comunitaria situado en la provincia de Gerona, comunidad autónoma de Cataluña, España. El espacio natural tiene una extensión de 853,8 km² y fue aprobado en septiembre de 2006. Es un río de la comarca del Alto Ampurdán, afluente del Muga por el lado izquierdo.
Nace en el Puig de Llobregat, pasa por La Junquera y recibe las aguas de la vertiente sur de la sierra de la Albera. Es un río de régimen pluvial, nutrido únicamente por las lluvias de otoño y de primavera y tiene un mínimo en agosto. Desemboca en el río Muga junto a la población de Perelada provincia de Gerona.
En cuanto a la diversidad biológica, hay que decir que es un río lleno de vida: lo pueblan las típicas especies de río catalán, barbos y truchas, cangrejos de río -actualmente dominado por el cangrejo de río americano, el autóctono casi ha desaparecido-, anguilas, Culebra viperina, salamandras, sapos, ranas etc. Las orillas están llenas de vegatación de ribera: alisos, chopos etc.
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