Mesoendothyrinae es una subfamilia de foraminíferos bentónicos de la familia Mesoendothyridae, de la superfamilia Loftusioidea, del suborden Loftusiina y del orden Loftusiida. Su rango cronoestratigráfico abarca desde el Ladeniense (Triásico medio) hasta el Portlandiense (Jurásico superior).
Clasificaciones previas elevaron Mesoendothyrinae a la categoría de familia (familia Mesoendothyridae), y la incluyeron en el suborden Textulariina, en el orden Textulariida o en el orden Lituolida.
Mesoendothyrinae incluye a los siguientes géneros:
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