R1a es un haplogrupo del cromosoma Y definido por los marcadores M420, M449, M511 y M513; desciende del haplogrupo R y su subclado principal y predominante es M17. R1a1a (M17) tiene gran difusión, encontrándose en una región que va de Escandinavia hasta la India; presentando dos máximos en cada uno de los extremos de esta área: uno en Europa Oriental, donde se encuentran densidades de más del 50 % entre los sorbios, polacos, bielorrusos, rusos, y ucranianos, y otro máximo en la región del Pamir, la cual se encuentra entre los límites de Asia Central con Asia Meridional en poblaciones como las castas hindúes brahmánica y ksatriya o los tayikos. También se encuentran frecuencias significativas en otras zonas de Asia Central, llegando hasta Siberia y, en Escandinavia, desde donde algunos portadores, posiblemente vikingos, se extendieron a Gran Bretaña. Se cree que la dispersión de este haplogrupo está relacionado con la expansión de las lenguas indoeuropeas (las cuales son habladas por casi la mitad de la población mundial), pero en especial por la expansión de las lenguas eslavas e indoiranias.
Hay varias teorías sobre el origen del haplogrupo R1a y están generalmente relacionadas con las migraciones indoeuropeas. Sin embargo estas teorías parecen referirse en realidad a R1a1a, ya que la presencia de la mutación M17 es la más común en la población y está ampliamente documentada. Según diversas teorías, R1a (M420 o M17) tiene un origen en el Asia Occidental, Europa oriental o Sur de Asia. Debido a la presencia de raros subclados basales en Irán y este de Turquía, se ha sugerido que R1a (M420) se habría originado en las cercanías de Irán hace unos 25 mil años; mientras que su subclado más frecuente, R1a1a1 (M417), tendría un origen europeo hace unos 5800 años, por lo que podría estar relacionado con el pueblo protoindoeuropeo.
Kivisild et al. (2003),indoarias a la India. Por otro lado Semino et al. (2000) propone el origen en el Cercano Oriente si tomamos en cuenta la idea de que aquí se habrían originado las lenguas indoeuropeas. Evidencia a favor del origen de R1a (M420) en el Próximo Oriente está en que en esta región encontramos la mayor diversidad, ya que se puede observar aquí presencia de los clados más antiguos como R1a* y R1a1*; en cambio R1a1a (M17) tiene su mayor diversidad está en Europa Oriental.
sostiene la teoría del origen en Asia occidental debido a la creencia en que allí se originaron las invasionesSegún la teoría del origen en Europa oriental, S. Wells, director del Proyecto Genográfico de la National Geographic, sostiene que R1a surgió hace 10 000 a 15 000 años en Ucrania o sur de la Rusia europea; esta región llamada "refugio de Ucrania", sirvió de protección durante el último máximo glaciar. O bien surgió un poco más al este en la estepa póntico-caspiana. En todo caso sería como resultado de las migraciones planteadas por la hipótesis de los kurganes, que sostiene que hay una relación entre la expansión de las lenguas indoeuropeas y el desarrollo de la cultura de los kurganes. Esta teoría se ve reforzada por la frecuencia mayor del 50 % en Ucrania y sur de Rusia (Wells 2001) y por la alta diversidad en la zona, además del inicio de la domesticación del caballo, importante vehículo de expansión cultural llevado a cabo hace más de 5000 años por los kurganes de Ucrania.
La teoría del origen de R1a en el Sur de Asia del genetista Stephen Oppenheimer de la Universidad de Oxford, fija el origen de este haplogrupo en el sur de Asia hace unos 36 000 años, desde donde posteriormente se habría extendido. Se basa en la diversidad de R1a en Pakistán, norte de la India y este de Irán.
La siguiente distribución corresponde mayormente al subclado R1a1a (M17), dada su preponderancia.
Los principales subclados se relacionan del siguiente modo:
R1a*: poco en el Cercano Oriente
R1a1*: raro en Europa y Cáucaso
L664: en Europa noroccidental
Z283: Europa Oriental (baltoeslavos) y Escandinavia
Z93: En Asia del Sur y Asia Central, menos en Cercano Oriente y Europa
R1a presenta las mutaciones M420/L146/PF6229, Y194, M449, etc. (sinónimos al 2013: L62/M513/PF6200, L63/M511/PF6203, L145/M449/PF6175). Los subgrupos R1a presentan la siguiente distribución:
Se encuentra poco en el Cercano Oriente: pequeñas frecuencias en Irán, Turquía, Emiratos Árabes Unidos, Omán y en el Cáucaso.
El haplogrupo R1a1 (SRY10831.2/SRY1532.2, M459/PF6235, L120/M516, L122/M448) se habría originado hace unod 18 mil años.
El haplogrupo R1a2 (Y19144, YP4141) es propio del Cercano Oriente, Cáucaso del Sur y Gran Bretaña.
Haplogrupos del cromosoma Y humano
Artem Lukichev tomó animación basada en la épica Bashkir Urales, que describe la historia de los grupos de haplogrupo R1: R1a y R1b.
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