Tomás Thayer Ojeda (Caldera (Chile), 6 de junio de 1877 - Santiago de Chile, 29 de junio de 1960); historiador, genealogista, paleógrafo y bibliotecario chileno. Fue autor de diversas investigaciones historiográficas, especialmente centradas en el período de la Conquista y la bibliografía colonial de Chile. Participó del grupo que refundó la Sociedad Chilena de Historia y Geografía en 1911; ejerció como director de la Biblioteca Nacional de Chile, cargo que entonces implicaba también la jefatura de la Dirección General de Bibliotecas, Archivos y Museos los años 1931 y 1932; en 1933 se convirtió en miembro de número de la Academia Chilena de la Lengua y fue uno de los fundadores de la Academia Chilena de la Historia.
Sus estudios los realizó en el Colegio Español-Inglés de Taltal (1885-1889) y el Colegio de San Agustín de Santiago (1891-1894), recibiendo el grado de báchiller en Filosofía y Letras (1895). No cursó educación universitaria. En su momento no pudo estudiar Derecho, por estar aquejado de una enfermedad a la vista. Por esta circunstancia terminó convirtiéndose en funcionario de la Biblioteca Nacional (1902), donde pronto fue ubicado en la Sección de Manuscritos. Este departamento, antes de ser empleado, lo conoció como visitante. Terminaría siendo jefe de la sección en 1909.
Thayer Ojeda afirmaba de sí mismo que había llegado a ser historiador por "herencia intelectual" de un par de ancestros lejanos, vívidos en tiempos de la Conquista, que señalaba, subrayándolos de entre los demás de su árbol genealógico. Entre estos listaba al cronista Pedro Mariño de Lobera y el poeta Fernando Álvarez de Toledo. Incorporó de hecho un estudio de la vida de este último dentro su primer trabajo de investigación: Memoria histórica sobre la familia Alvarez de Toledo en Chile, que publicó en los Anales de la Universidad de Chile por la intercesión de Domingo Amunátegui Solar.
En su labor en la Sección de Manuscritos se perfeccionó hasta que, en opinión de Guillermo Feliú Cruz, "se hizo el más diestro paleógrafo que hubo en Chile, superior a Medina", con numerosos artículo y libros basados en sus investigaciones de los archivos coloniales y de la Conquista. Trabajos entre los que destaca: Santiago durante el siglo XVI: Constitución de la propiedad urbana y noticias de sus primeros pobladores (1905), que incluyé un citado mapa pormenorizado de Santiago de la segunda mitad del siglo XVI.
Entre 1909 y 1914 se encargó de la publicación de los tomos XV, XVI, XVII, XVIII, XIX, XX, XXIV y XXVI de la Colección de historiadores i de documentos relativos a la independencia de Chile.
En 1925 se crea el Archivo Nacional, y aunque el puesto de director le habría estado destinado a Thayer Ojeda, una supuesta "intriga política" le habría privado de este empleo. Su carrera en la Biblioteca Nacional culminó en la jefatura de la institución, que impicaba el cargo de Director General de Bibliotecas, Archivos y Museos, entre los años 1931 y 1932. Entre otras organizaciones integró la Academia Chilena de la Historia, la Sociedad Científica de Chile, la Academia Chilena de la Lengua (sillón nº 5), siendo además cofundador del Instituto de Conmemoriación Histórica de Chile y de la Sociedad Chilena de Historia y Geografía.
Desde 1916 también ejerció como perito caligráfico en juicios, sobre todo en el análisis de antiguos documentos relativos a la propiedad de tierras, hasta que, según decía, "el agotamiento de mi vista me impidió proseguir tan delicadas tareas". Así mismo, el Ministerio de Relaciones Exteriores de Chile lo ocupó como experto paleógrafo en Comisión Plesbicitaria de Tacna y Arica. Realizó una solitaria incursión en las ciencias con una breve obra sobre física: Hipótesis sobre la formación de la materia (1939), que en 1940 era anunciada como "primera parte" de una obra mayor, pese a lo cual Thayer Ojeda nunca volvería a publicar sobre el tema.
De entre su labor historiografica también cabe destacar la polémica mantenida con Aniceto Almeyda Arroyo en los años 1944 y 1945. En ese discusión Thayer defendendió la tradicional atribución del poema y crónica de Indias del siglo XVII Purén Indómito a Fernando Álvaro de Toledo, su propio ancestro con el que se había iniciado en la investigación historiográfica, mientras que Almeyda señaló que el verdadero autor era Diego Arias de Saavedra, siendo esta última atribución la que actualmente se considera acertada.
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