Comahuesuchus es un género extinto crocodilomorfo notosuquio que vivió durante el Cretácico Superior en Argentina. Fue descrito por el paleontólogo argentino José Bonaparte en 1991. La especie tipo del género es C. brachybuccalis.
El holotipo de C. brachybuccalis es el ejemplar catalogado como MUCPv-202.
Comahuesuchus es el género epónimo del clado Comahuesuchidae. Sereno et al. (2003) sugirieron que Comahuesuchus y Anatosuchus son ambos comahuesúquidos, pero el análisis realizado por Martinelli y Andrade et al. (2006), ha sugerido que A. minor no es un comahuesúquido. Comahuesuchus parece en cambio estar más cercanamente relacionado con Mariliasuchus.
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