El Museo Alfredo Dugès, se ubica en la planta baja del Edificio Central de la Universidad de Guanajuato.
Cuenta con 5 salas, siendo las siguientes:
En ella encontramos ejemplares que pertenecieron al antiguo gabinete de historia natural del Colegio del Estado (hoy Universidad de Guanajuato)
Organizado por ambientes, en los cuales se encuentra el Ambiente Marino, en el cual se observan: corales, caracoles, tiburones y tortugas. El Ambiente Terrestre, en el cual se observan especies de mamíferos y aves.
Aquí se encuentran algunos ejemplares fósiles.
En este espacio se encuentran ejemplares de especies que se encuentran en riesgo o se han considerado extintas.
Esta sala exhibe especies que pertenecen a alguna región del Estado de Guanajuato.
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