José Luis Fernández Alonso ( 1959, provincia de Valladolid) es un botánico español de nacimiento y colombiano de adopción.
Nacido en Encinas de Esgueva, una población del noroccidente de la provincia de Valladolid (España) se licencia en Biología por la Universidad de Salamanca, trabaja durante un tiempo en el Real Jardín Botánico de Madrid, bajo la dirección de Santiago Castroviejo, con quién concluyó en 1985, la tesis de grado de una "Flórula del Noroccidente de la provincia de Valladolid", y en 1993 la tesis de Doctorado (monografía del género neotropical Aragoa - familia Scrophulariaceae).
En el Real Jardín Botánico de Madrid, entra en contacto con la flora neotropical a través de los herbarios históricos de Mutis, Ruiz y Pavón e Isern (de Colombia, Perú, Chile y Ecuador), despertando su interés sobre la Flora de esta región y sobre todo enfocado en la familia Scrophulariaceae.
En 1986, se traslada a Colombia y trabaja primero como becario y después 1987-1990 como Botánico Cooperante de la AECI, en el « Proyecto Flora de la Real Expedición Botánica del Nuevo Reino de Granada », en el Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia.
Entre 1991 y 2009, ejerce la docencia y la investigación en el Instituto de Ciencias Naturales, Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de Colombia, en Bogotá, capacitando a nuevos biólogos en el área de la taxonomía vegetal y de la flora colombiana.
En el Instituto de Ciencias fue Curador General del Herbario Nacional Colombiano (COL), en el periodo de 1996 al 2000 e interactúa con otros herbarios regionales de otras Universidades del país (AFP, BOG, CAUP, COAH, CUVC, FAUC, FMB, HECASA, HUA, HUQ, JAUM, MEDEL, PSO, SURCO, UIS, UPTC, UTMC y VALLE) donde han sido depositadas muchas de sus colecciones de plantas vasculares. A partir del 2009, ingresa al CSIC como investigador (Científico Titular) en su sede del Real Jardín Botánico de Madrid para trabajar en Biodiversidad Vegetal en Áreas Tropicales.
Estudios sobre los grupos de Lamiales (Labiatae y Scrophulariaceae) y Malvales (Bombacaceae) del ámbito neotropical.
Revisión de algunos géneros concretos o grupos puntuales de otras familias como Brassicaceae, Cactaceae, Rhamanaceae o Trigoniaceae.
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