En genética humana, el haplogrupo D (CTS3946) es un haplogrupo del cromosoma Y humano típico del Extremo Oriente, especialmente frecuente en el Tíbet, en el archipiélago del Japón y en las islas de Andamán (al sudeste de la India), y esporádicamente en África, Asia Occidental y Filipinas.
Un estudio reciente (Haber et al.2019) consideró varias varias posibilidades para el origen del haplogrupo D (CTS3946), incluyendo un origen asiático occidental y uno africano, finalmente el estudio se inclinó a favor de un origen africano y quizás provenga de África Oriental o África del Norte; con una antigüedad de unos 64,700 - 83,000 años. Pero su descendencia más extendida (haplogrupo D-M174) tiene un origen asiático y una antigüedad de 50,000 o 60,000 años En sus orígenes es próximo al haplogrupo E (descienden de DE) y las mutaciones que lo definen son CTS3946, CTS4030/Z1605 y otras.
Al igual que el haplogrupo C, se cree que D representa también la "gran migración costera" a lo largo del sur de Asia y es originaria de las poblaciones más antiguas en varias zonas del continente.
D0 (A5580.2): encontrado en Nigeria y Cercano Oriente.
D1b (L1378): en Cebú (Filipinas)
D1a1 (Z27276): principalmente en el Tíbet, extendido en Asia Oriental
D1a2b (Y34637): en nativos de las islas Andamán
D1a2a (M55): típico del Japón, destacan los ainu
Según ISOGGG,
los subgrupos del haplogrupo D se ordenan del siguiente modo:D0 o D2 (A5580.2) fue identificado previamente como DE* en poblaciones africanas, lo que sería una señal del origen africano del haplogrupo D y de que la migración fuera de África de los humanos modernos estaría representada por los haplogrupos D1 y CF, mientras que D0 y E habrían permanecido en África. La divergencia entre D-M174 y D0 habría sido entre hace 50 a 59 mil años atrás.
D0 o D2 se ha encontrado en Nigeria, Arabia Saudita y Siria
D1 (M174/Page30, Z1591) es típico del Asia Oriental, fue conocido simplemente como D desde 2002 y renombrado como D1 recientemente (2019). Posee una antigüedad de unos 65 mil años.
Haplogrupos del cromosoma Y humano
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